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Ryan Hisner @ryanhisner.bsky.social · 8h

I realized later today that I'd given the S:T124I mutation in this new sequence short shrift.

T->I amino acid changes may be the most common type, yet it's very rare (<0.01% of sequences). Why?

Because it removes a conserved glycan from N122! (Which is also conserved in SARS-CoV-1). 1/3

Eight of the 22 sites were determined to be occupied predominantly with high-mannose-type structures by Watanabe et al. (N61, N122, N234, N603, N709, N717, N801, and N1074).29 However, Shajahan et al., Walls et al., and Zhang et al. noted an abundance of complex-type glycans (Figure 1.1).30,48 Specifically, the preserved glycosites between SARS-CoV-1 and SARS-CoV-2 (N61, N122, N603, N709, N801, and N1074), which had previously been characterized as containing only high-mannose-type glycans, have since been identified as containing complex-type glycans.24,27,29,30 Sites N165, N331, and N343 express complex-type N-glycans containing both bi- and tri-antennary
structures.

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thetranscendedman @atranscendedman.bsky.social · 15h

Mexican researchers analyzed sweat from 426 people and found six compounds that differ in COVID-positive patients.

Levels of palmitic and oleic acids rose, while squalene fell, allowing 80% accurate detection through sweat alone.

www.nature.com/articles/s41...

Client Challenge

www.nature.com

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Ryan Hisner @ryanhisner.bsky.social · 17h

There's a new BA.3.2.2 from South Africa today. For the most part, there's been little substantial change in BA.3.2 over the past few months—mostly synonymous mutations & very little happening in spike.

But this new one has 3 spike mutations & looks quite interesting. 1/6

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Dr. McCoy 😷 @drmccoy.info · 18h

Nicht mal DANN wird gegen Covid19 geimpft. Das ist wirklich, und es ist gar nicht mehr anders zu formulieren, ein partielles Armutszeugnis für jene Medizinerinnen und Mediziner, die es so handhaben.⬇️

#TeamVernunft #ImpfenSchützt #Covid19

Toybox @toybox.bsky.social · 18h

"Keine Indikation für die Impfung", also außerhalb der Stiko-Kriterien vermute ich. (Krebskranke Partnerin und Ü-90 Familienangehörige im Umfeld, mir Herzinfarkt im August, zählt also nicht mit)

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Michael Stingl @neurostingl.bsky.social · 18h

Ich bin schon recht lange mit #MECFS befasst.

Als ich begonnen habe, wurde es ignoriert. Das war damals recht einfach, es gab kein öffentliches Bewusstsein für die Problematik.

Es gab aber schon damals eine Definition für ME/CFS und Hinweise, dass es nicht selten ist.

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Initiative #ProtectTheKids @protectthekids.bsky.social · 19h

Obacht #Wiesnwelle - in #Bayern weisen die Abwasserwerte auf steigende #Corona-Neuinfektionszahlen hin🦠🤧🤒
Legt man den von @rv-enigma.bsky.social geschätzten Dunkelzifferfaktor 105 zugrunde, ist die 7-Tages-Inzidenz in #München inzwischen auf 2163 geklettert📈😳
FFP2-#MaskenSchützen😷

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Sam @humanmanifold.bsky.social · 22h

Am 15. Oktober protestiert die Organisation „Kinder ME/CFS“ mit 100 Leichensäcken vor dem Forschungsministerium gegen fehlende Forschung zu #MECFS und #LongCovid. 1,5 Mio. Betroffene fordern eine Forschungsdekade nach dem Krebs-Vorbild.

www.tagesspiegel.de/berlin/100-l...

100 Leichensäcke vor Forschungsministerium in Berlin: Patientenorganisation protestiert gegen fehlende Forschung bei Long Covid

Ein Zusammenschluss von Eltern an Long Covid erkrankter Kinder demonstriert in Berlin gegen fehlende Forschungsgelder beim Chronischen Fatigue Syndrom.

www.tagesspiegel.de

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Kathryn Hoffmann @kathrynhoffmann.bsky.social · 1d

Ich persönlich verstehe ja nicht, was es in Bezug auf PAIS- und ME/CFS-Definition und Bedarfserhebung für Versorgung noch zu diskutieren gibt. Der Lackmustest ist klar und einfach: Wenn in einer Behandlungseinrichtung ME/CFS-Erkrankte adäquate Behandlung bekommen (auch zuhause), dann zählt
1/n

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RV @rv-enigma.bsky.social · 1d

Covid-19 in der Woche 7.10.-13.10.
Fälle (FT-korr): +34%‼️, R↗️1,17-1,18

Inzidenz:
-Fälle inkl. DZF 105: ~750
-Abwasser: 499 [428]
-Grippeweb: 400 (500)

Hospitalisierung: 282, R_14TQ↗️1,19
ITS_Belegung (7TM): 116, ↗️R=1,18
... Erstaufn. (14TM): 12,5, ↗️R=1,18

Die Grafik zeigt ab 2024 auf linearer Skala oben die Fallmeldungen (nach Berichts- und Meldedatum) und die Inzidenz nach den Abwasserdaten (normalisiert mit 5-Wochen-Mittel und nicht normalisiert mitLOESS-Glättung).
Unten stehen die R-Werte der Fälle (FT-korrigiert) und der Viruslast im Abwasser (beide Versionen).

Diese Grafik zeigt exakt dieselben Daten wie die erste, nur in logarithmischer Skalierung.

Das hat den Vorteil, dass die prozentual gleiche Veränderungen gleich dargestellt werden und ein exponentieller Anstieg oder Rückgang als gerade Linie deutlich sichtbar wird (z.B. der Rückgang im Frühjahr '24 oder der Anstieg der letzten Monate).
Zudem kann man Daten mit sehr großen Schwankungen (hier etwa die Fallmeldungen mit Unterschieden um den Faktor 50) in einer Grafik darstellen, ohne dass man bei den niedrigen Zahlen die Entwicklung kaum noch sehen kann.

Die Grafik zeigt ab 1.1.25
- blau: die Berichtsdaten (korrigiert)
- braun: die aus den AMELAG-Daten (NICHT NORMALISIERT) abgeleitete Inzidenz
... gepunktet: LOESS-geglättet
- schwarz Strich-Punkt: den daraus abgeleiteten Dunkelzifferfaktor
- grün: die Inzidenz inkl. Dunkelziffer

Die Grafik zeigt ab 1.1.25
- blau: die Berichtsdaten (korrigiert)
- braun: die aus den AMELAG-Daten (NORMALISIERT) abgeleitete Inzidenz
... gepunktet: 35-Tage-Mitte geglättet
- schwarz Strich-Punkt: den daraus abgeleiteten Dunkelzifferfaktor
- grün: die Inzidenz inkl. Dunkelziffer

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Michael Stingl @neurostingl.bsky.social · 1d

Fassen wir überspitzt zusammen:

Für normale Versorgung von #MECFS ist kein Geld da und man ist mancherorts nicht bereit, vom überholten Dogma von ME/CFS als psychiatrischer Erkrankung abzuweichen.

Es ist ein trauriges Schauspiel.

www.sn.at/panorama/wis...

Verzögerung bei Versorgungsplan zu ME/CFS und Post Covid

Die Umsetzung des "Aktionsplans" zu postakuten Infektionssyndromen (PAIS) dürfte sich weiter verzögern. Mit dem Plan soll die medizinische und soziale Versorgung etwa von Post Covid- oder ME/CFS-Patie...

www.sn.at

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Mike Honey @mikehoney.bsky.social · 2d

Here's the latest variant picture for Europe (excluding the UK), to late September.

The XFG.* "Stratus" variant continued to dominate, growing to 85% frequency.

NB.1.8.1 "Nimbus" grew slightly to 10%.

#COVID19 #SARSCoV2 #EUR #LP_8_1 #XFG #Stratus #NB_1_8_1 #Nimbus
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Mike Honey @mikehoney.bsky.social · 2d

With the NB.1.8.1.* "Nimbus" and XFG.* "Stratus" variants carving up dominance around the globe, it is time to ponder which variant might drive the next wave.

The leading contender at this point is PY.1.1.1.

#COVID19 #SARSCoV2 #PY_1_1_1 #XFG_1_1
🧵

1 12 44

Ralf Wittenbrink @ralfwittenbrink.bsky.social · 2d

den Bedingungen der Influenza-Saison vor der Pandemie ähnelt.“

jamanetwork.com/journals/jam...

Enduring Outcomes of COVID-19 Work Absences on the US Labor Market

This cohort study examines the extent to which COVID-19 continues to generate work absences and decrease labor force participation beyond the pandemic period in the US.

jamanetwork.com

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Ralf Wittenbrink @ralfwittenbrink.bsky.social · 2d

anhaltende Anstieg krankheitsbedingter Fehlzeiten könnte auf eine grundlegende Veränderung des Krankheitsumfelds in den USA hinweisen.
Die Introduktion und anhaltende Verbreitung von SARS-CoV-2 könnte eine neuen, ganzjährigen Basiswert für Arbeitsausfälle geschaffen haben, der

Abbildung 2. Gesundheitsbedingte Fehlzeiten am Arbeitsplatz auf Bundesstaatsebene im Vergleich zur viralen Aktivität im Abwasser aufgrund von COVID-19

Die Grafiken zeigen Streudiagramme mit linearer Anpassung des Zusammenhangs zwischen krankheitsbedingten Fehlzeiten und der COVID-19-Virusaktivität im Abwasser auf Bundesstaatsebene. Die angezeigten Zeiträume basieren auf der Verfügbarkeit von Abwasserüberwachungsdaten und sind in den Zeitraum während der Pandemie (Februar 2022 bis April 2023; A) und nach dem Ende des öffentlichen Gesundheitsnotstands (Mai 2023 bis Dezember 2024; B) unterteilt. Nicht alle Bundesstaaten stellen Daten für den gesamten Zeitraum zur Verfügung, und Daten aus North Dakota sind nicht verfügbar.

1 4 41

Ralf Wittenbrink @ralfwittenbrink.bsky.social · 2d

Dauerhafte Folgen der COVID-19-bedingten Arbeitsausfälle auf dem US-Arbeitsmarkt

„Die anhaltende Verbreitung von SARS-CoV-2 wirkt sich negativ auf die US-Arbeitskräfte aus, da krankheitsbedingte Fehlzeiten und das anschließende Ausscheiden aus dem Arbeitsmarkt zunehmen. Der …

Figure 4. National Excess Labor Force Exits After a Health-Related Absence, January 2010 to December 2024
Die Grafik zeigt die monatlichen Überabgänge aus dem Erwerbsleben nach gesundheitsbedingten Ausfällen (in Tausend). Diese Überabgänge wurden berechnet, indem die monatlichen Durchschnittswerte der Erwerbsausgänge vor der Pandemie (Januar 2010 bis Februar 2020) von der tatsächlichen Zahl der Erwerbsausgänge nach Ausbruch der Pandemie (März 2020 und später) abgezogen wurden. Die gestrichelte Linie steht für März 2020 (Beginn der Pandemie), die gepunktete Linie für Mai 2023 (Ende des öffentlichen Gesundheitsnotstands).

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DrChronically M.D. @drchronically.bsky.social · 2d

Dann breche ich auch gleich mal eine Lanze für #Impfungen:

Auch wenn es tendenziell noch eher früh ist, habe ich mich am Mittwoch und die Kinder gestern Abend gegen #Grippe geimpft.

Ich impfe immer zu Beginn der Herbstferien, da meine Jungs dazu neigen Fieber nach einer Impfung zu bekommen
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Wilde Karde (sie/ihr) @wildekarde.bsky.social · 3d

In den letzten Tagen haben sich mir zwei Mütter "offenbart", dass sie ihre Kinder gegen Grippe impfen lassen. Beide haben das mit einer gewissen Vorsicht und Verteidigungshaltung vorgetragen. Wie ätzend ist das bitte, dass Eltern Angst haben müssen wegen einer #Impfung angefeindet zu werden?

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Tove Harris @toveharris.bsky.social · 2d

René Martens über das Buch "Die verdrängte Pandemie" (Hrsg. Frédéric Valin @freval.bsky.social und @paulschuberth.bsky.social), das eine der signifikanten Schwächen des deutschen Journalismus aufzeigt, die Angst vor neg. Reaktionen bei CDU, AfD und deren Multiplikatoren, speziell beim Thema #COVID.

Altpapier @altpapier.bsky.social · 3d

Schulschließungen? Katastrophal! So einer der Gassenhauer des Pandemie-Nachbetrachtungsjournalismus. Gegenposition: „Im Nachhinein die Schulschließungen zu verteufeln, heißt doch, die Kinder und Jugendlichen als des Infektionsschutzes nicht wert zu empfinden.“ (1/x) www.mdr.de/altpapier/da...

Kolumne: Das Altpapier am 10. Oktober 2025 – Ein andauerndes Problem | MDR.DE

Dass Schulschließungen katastrophal gewesen seien, gehört zu den Gassenhauern des Pandemie-Nachbetrachtungsjournalismus.

www.mdr.de

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Tove Harris @toveharris.bsky.social · 2d

SARS-CoV-2 habe gelernt, mit unserem Immunsystem zu koexistieren, ohne sich neu erfinden zu müssen. Vertrautheit mit dem Virus sei jedoch nicht gleichbedeutend mit Kontrolle. Seine stille Persistenz reiche aus, um die Gesundheit langfristig zu schädigen.

#COVID

gacetamedica.com/opinion/la-f...

La falsa calma de un COVID-19 domesticado Gaceta Médica Opinión -

La salud mental y las prioridades de la comisionada del ministerio de sanidad que trata de prevenir el suicidio y su incremento

gacetamedica.com

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RV @rv-enigma.bsky.social · 2d

Covid-19 am 11.10.25: R↗️1,18

R_Berichte (FT-korr) 1,18
R_Meldungen (adj, ohne FT-Korr.) 1,39⁉️
R_Hospitalisierung: 1,17

Inkl. DZF ↘️105:
Fälle (7T-M, korr): 88.500
Inzidenz: 740 (560)

Verdopplungszeit: 17 Tage
Infiziert: 1 von ~95

Die Grafik zeigt oben die 7T-Mittel der Fallmeldungen nach Berichtsdatum (blau, ohne Nachmeldungen für mehr als 30 Tage zurück liegende Daten und um geschätzte Daten für Feiertage korrigiert) sowie die Fallzahl nach Meldedatum, adjustiert mit einem Nowcast der Nachmeldungen (rot). Außerdem ist die aus der NORMALISIERTEN Abwasser-Viruslast berechnete Inzidenz (braun gepunktet) sowie der aktuelle Dunkelzifferfaktor (schwarz gestrichelt) und die Inzidenz nach Berichtsdatum inkl. DZF (grün) aufgetragen.

Im unteren Bereich stehen gestrichelt R-Werte (d.h. geglättete 4-Tages-Änderungen):
Fälle nach Berichts- und Meldedatum, Viruslast (AMELAG zentriertes 5W-Mittel) und ITS-Belegung.

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Mike Honey @mikehoney.bsky.social · 2d

The trickle of BA.3.2.2 samples from Western Australia has continued.

While the frequencies of this variant are still quite low, it’s ongoing spread (likely to many thousands of infections by now) gives it every opportunity to acquire the mutations it needs to succeed.

#COVID19 #Australia
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Mike Honey @mikehoney.bsky.social · 2d

Here's the latest variant picture with a global scope, to late September.

XFG.* "Stratus" was higher at 73%.

NB.1.8.1 "Nimbus" fell to 18%.

#COVID19 #SARSCoV2 #Global #NB_1_8_1 #Nimbus #XFG #Stratus
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Eric Feigl-Ding @drericding.bsky.social · 3d

Guess who just got both the updated COVID vaccine and flu shots today? Your dear Leader Trump. Maybe you should get them too.

Sincerely, An Epidemiologist Who Told You Trump Would Get COVID Booster.

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Dominik Steiger @dominiksteiger.bsky.social · 3d

"Enduring Outcomes of COVID-19 Work Absences on the US Labor Market" - sick all through the year.

"These findings suggest that COVID-19 may have created a new year-round baseline for work absences that is similar to influenza season conditions before the pandemic"

jamanetwork.com/journals/jam...

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JPWeiland @jpweiland.bsky.social · 3d

Lacking CDC data again this week, we turn to our secondary wastewater source
@wastewaterscan.bsky.social

🔸The trajectory through September suggests that we may be approaching yearly lows today of 150-200k/day.

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Danielle Beckman @daniellebeckman.bsky.social · 3d

Viral trigger in Alzheimer’s disease is the real scary spooky #FluorescenceFriday.
Amyloid-β🟣 is an antimicrobial peptide that can be produced to trap pathogens in the brain. But it also induces an extensive neuroinflammatory response, as shown here with 🟠astrocytes. #NeuroCovid

Confocal microscopy photo showing astrocytes and amyloid-B

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