Sergio Alías Segura
@seraliseg.bsky.social
Bioinformatics, Computational Biology, Programming. PhD candidate at Complutense.
En este #HiloTesis habéis visto cómo estudiamos los suelos de cereal en busca de hongos productores de micotoxinas que puedan contaminar el cultivo y ponernos en riesgo. ¡Muchas gracias por leer! 🙌
@crueuniversidades.bsky.social @filarramendi.bsky.social @ucm.es @ucccomplutense.bsky.social
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June 12, 2025 at 9:59 PM
En este #HiloTesis habéis visto cómo estudiamos los suelos de cereal en busca de hongos productores de micotoxinas que puedan contaminar el cultivo y ponernos en riesgo. ¡Muchas gracias por leer! 🙌
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Conocer qué hongos toxígenos hay en los cultivos nos permite diseñar estrategias para frenar su crecimiento y evitar que las micotoxinas lleguen a la comida.
Pero no podemos bajar la guardia: el cambio climático está alterando la distribución de estos hongos. ¡Estad listos para el próximo caso! 🌍🕵️♂️
Pero no podemos bajar la guardia: el cambio climático está alterando la distribución de estos hongos. ¡Estad listos para el próximo caso! 🌍🕵️♂️
June 12, 2025 at 9:59 PM
Conocer qué hongos toxígenos hay en los cultivos nos permite diseñar estrategias para frenar su crecimiento y evitar que las micotoxinas lleguen a la comida.
Pero no podemos bajar la guardia: el cambio climático está alterando la distribución de estos hongos. ¡Estad listos para el próximo caso! 🌍🕵️♂️
Pero no podemos bajar la guardia: el cambio climático está alterando la distribución de estos hongos. ¡Estad listos para el próximo caso! 🌍🕵️♂️
Tal y como esperábamos, la región EF-1α (las "huellas dactilares") han permitido identificar al culpable: Fusarium brachygibbosum, productor de micotoxinas como los tricotecenos ⚠️
Los otros dos sospechosos están limpios: son Fusarium solani, un hongo que no supone ningún peligro ✅
Los otros dos sospechosos están limpios: son Fusarium solani, un hongo que no supone ningún peligro ✅
June 12, 2025 at 9:59 PM
Tal y como esperábamos, la región EF-1α (las "huellas dactilares") han permitido identificar al culpable: Fusarium brachygibbosum, productor de micotoxinas como los tricotecenos ⚠️
Los otros dos sospechosos están limpios: son Fusarium solani, un hongo que no supone ningún peligro ✅
Los otros dos sospechosos están limpios: son Fusarium solani, un hongo que no supone ningún peligro ✅
¡Yo soy bioinformático! ¡No está todo perdido!
Durante mi tesis he podido recopilar muchísimas secuencias de EF-1α con las que he entrenado un clasificador para identificar a los Fusarium rebeldes de una vez por todas.
Sólo hay que probarlo a ver si funciona... 🤞
¿Me acompañas a resolver el caso?
Durante mi tesis he podido recopilar muchísimas secuencias de EF-1α con las que he entrenado un clasificador para identificar a los Fusarium rebeldes de una vez por todas.
Sólo hay que probarlo a ver si funciona... 🤞
¿Me acompañas a resolver el caso?
a close up of a cartoon character wearing glasses and a red bow tie .
ALT: a close up of a cartoon character wearing glasses and a red bow tie .
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June 12, 2025 at 9:59 PM
¡Yo soy bioinformático! ¡No está todo perdido!
Durante mi tesis he podido recopilar muchísimas secuencias de EF-1α con las que he entrenado un clasificador para identificar a los Fusarium rebeldes de una vez por todas.
Sólo hay que probarlo a ver si funciona... 🤞
¿Me acompañas a resolver el caso?
Durante mi tesis he podido recopilar muchísimas secuencias de EF-1α con las que he entrenado un clasificador para identificar a los Fusarium rebeldes de una vez por todas.
Sólo hay que probarlo a ver si funciona... 🤞
¿Me acompañas a resolver el caso?
La comunidad científica lleva MUCHO TIEMPO usando la ITS2: a día de hoy tenemos clasificadores (programas que identifican las secuencias de ADN) entrenados para ITS2, pero no para EF-1α...
Para colmo, entrenar un clasificador desde cero lleva consigo mucho trabajo bioinformático...
Un momento... 🤔
Para colmo, entrenar un clasificador desde cero lleva consigo mucho trabajo bioinformático...
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a man in a suit and tie is eating a piece of meat .
ALT: a man in a suit and tie is eating a piece of meat .
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June 12, 2025 at 9:59 PM
La comunidad científica lleva MUCHO TIEMPO usando la ITS2: a día de hoy tenemos clasificadores (programas que identifican las secuencias de ADN) entrenados para ITS2, pero no para EF-1α...
Para colmo, entrenar un clasificador desde cero lleva consigo mucho trabajo bioinformático...
Un momento... 🤔
Para colmo, entrenar un clasificador desde cero lleva consigo mucho trabajo bioinformático...
Un momento... 🤔
Se ha demostrado en estudios recientes que EF-1α es tan variable en Fusarium que nos permite distinguir entre sus especies 😯
Es como si mirásemos las huellas dactilares de los sospechosos. De esta no se escapan 😤
Pero no cantes victoria tan pronto: tenemos un último problema que resolver... 🧩
Es como si mirásemos las huellas dactilares de los sospechosos. De esta no se escapan 😤
Pero no cantes victoria tan pronto: tenemos un último problema que resolver... 🧩
a picture of stitch with the words please stop torturing me on the bottom
ALT: a picture of stitch with the words please stop torturing me on the bottom
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June 12, 2025 at 9:59 PM
Se ha demostrado en estudios recientes que EF-1α es tan variable en Fusarium que nos permite distinguir entre sus especies 😯
Es como si mirásemos las huellas dactilares de los sospechosos. De esta no se escapan 😤
Pero no cantes victoria tan pronto: tenemos un último problema que resolver... 🧩
Es como si mirásemos las huellas dactilares de los sospechosos. De esta no se escapan 😤
Pero no cantes victoria tan pronto: tenemos un último problema que resolver... 🧩
¡La investigación peligra! ⚠️ ¿Qué podemos hacer?
Que no cunda el pánico. La ITS2 es, en general, una buena región marcadora... pero no es la única 🧬
Os presento al factor de elongación, o EF-1α para los amigos 💪
Que no te asuste la imagen, es una región de ADN como cualquier otra ⬇️
Que no cunda el pánico. La ITS2 es, en general, una buena región marcadora... pero no es la única 🧬
Os presento al factor de elongación, o EF-1α para los amigos 💪
Que no te asuste la imagen, es una región de ADN como cualquier otra ⬇️
June 12, 2025 at 9:59 PM
¡La investigación peligra! ⚠️ ¿Qué podemos hacer?
Que no cunda el pánico. La ITS2 es, en general, una buena región marcadora... pero no es la única 🧬
Os presento al factor de elongación, o EF-1α para los amigos 💪
Que no te asuste la imagen, es una región de ADN como cualquier otra ⬇️
Que no cunda el pánico. La ITS2 es, en general, una buena región marcadora... pero no es la única 🧬
Os presento al factor de elongación, o EF-1α para los amigos 💪
Que no te asuste la imagen, es una región de ADN como cualquier otra ⬇️
La región ITS2 no es tan variable en Fusarium como en otros hongos. Nos da lo justo para saber que es un Fusarium… y a veces ni eso 😬
¿Recordáis el ejemplo del principio? "El culpable lleva gafas y sombrero..." Pues para Fusarium, el ITS2 son las gafas y el sombrero 🕶️🎩, no nos sirve de nada 🤦
¿Recordáis el ejemplo del principio? "El culpable lleva gafas y sombrero..." Pues para Fusarium, el ITS2 son las gafas y el sombrero 🕶️🎩, no nos sirve de nada 🤦
June 12, 2025 at 9:59 PM
La región ITS2 no es tan variable en Fusarium como en otros hongos. Nos da lo justo para saber que es un Fusarium… y a veces ni eso 😬
¿Recordáis el ejemplo del principio? "El culpable lleva gafas y sombrero..." Pues para Fusarium, el ITS2 son las gafas y el sombrero 🕶️🎩, no nos sirve de nada 🤦
¿Recordáis el ejemplo del principio? "El culpable lleva gafas y sombrero..." Pues para Fusarium, el ITS2 son las gafas y el sombrero 🕶️🎩, no nos sirve de nada 🤦
Fusarium no va a ponernos nada fácil este caso 🕵️♂️
Dentro del género Fusarium hay un montón de especies diferentes. Algunas producen micotoxinas, otras no.
Tú podrías pensar: “No hay problema, podemos usar el ITS2 para diferenciarlas”.
Y yo te diría: … ¿podemos? 🤨
Dentro del género Fusarium hay un montón de especies diferentes. Algunas producen micotoxinas, otras no.
Tú podrías pensar: “No hay problema, podemos usar el ITS2 para diferenciarlas”.
Y yo te diría: … ¿podemos? 🤨
a man and a woman are standing next to each other in a park .
ALT: a man and a woman are standing next to each other in a park .
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June 12, 2025 at 9:59 PM
Fusarium no va a ponernos nada fácil este caso 🕵️♂️
Dentro del género Fusarium hay un montón de especies diferentes. Algunas producen micotoxinas, otras no.
Tú podrías pensar: “No hay problema, podemos usar el ITS2 para diferenciarlas”.
Y yo te diría: … ¿podemos? 🤨
Dentro del género Fusarium hay un montón de especies diferentes. Algunas producen micotoxinas, otras no.
Tú podrías pensar: “No hay problema, podemos usar el ITS2 para diferenciarlas”.
Y yo te diría: … ¿podemos? 🤨
El ITS2 es considerado el marcador universal para hongos. Permite diferenciar entre unos y otros porque cada hongo tiene un ITS2 único.
O bueno, casi todos... 😅
¿Recordáis a Fusarium?
O bueno, casi todos... 😅
¿Recordáis a Fusarium?
a man in a red shirt is asking who missed me ?
ALT: a man in a red shirt is asking who missed me ?
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June 12, 2025 at 9:59 PM
El ITS2 es considerado el marcador universal para hongos. Permite diferenciar entre unos y otros porque cada hongo tiene un ITS2 único.
O bueno, casi todos... 😅
¿Recordáis a Fusarium?
O bueno, casi todos... 😅
¿Recordáis a Fusarium?
Los seres vivos tienen (¡tenemos!) muchísimo ADN: no es eficiente gastarse un dineral en secuenciar todo lo que encontremos en el suelo de cultivo 💸
Tenemos que centrarnos en una región lo suficientemente variable como para distinguir entre hongos.
Una región como la ITS2 ⬇️
Tenemos que centrarnos en una región lo suficientemente variable como para distinguir entre hongos.
Una región como la ITS2 ⬇️
June 12, 2025 at 9:59 PM
Los seres vivos tienen (¡tenemos!) muchísimo ADN: no es eficiente gastarse un dineral en secuenciar todo lo que encontremos en el suelo de cultivo 💸
Tenemos que centrarnos en una región lo suficientemente variable como para distinguir entre hongos.
Una región como la ITS2 ⬇️
Tenemos que centrarnos en una región lo suficientemente variable como para distinguir entre hongos.
Una región como la ITS2 ⬇️
¡El ADN! Elemental, querido Watson 🔎
El ADN es diferente para cada organismo, así que usamos técnicas de secuenciación para "leer" todo el ADN de una muestra de suelo del cultivo 👀
Aquí entra en juego la Bioinformática, ya que obtenemos archivos de texto con las secuencias (A, C, G y T) 📑
El ADN es diferente para cada organismo, así que usamos técnicas de secuenciación para "leer" todo el ADN de una muestra de suelo del cultivo 👀
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June 12, 2025 at 9:59 PM
¡El ADN! Elemental, querido Watson 🔎
El ADN es diferente para cada organismo, así que usamos técnicas de secuenciación para "leer" todo el ADN de una muestra de suelo del cultivo 👀
Aquí entra en juego la Bioinformática, ya que obtenemos archivos de texto con las secuencias (A, C, G y T) 📑
El ADN es diferente para cada organismo, así que usamos técnicas de secuenciación para "leer" todo el ADN de una muestra de suelo del cultivo 👀
Aquí entra en juego la Bioinformática, ya que obtenemos archivos de texto con las secuencias (A, C, G y T) 📑
Vamos a tener que utilizar nuestras dotes detectivescas 🕵️♂️
Pensemos: ¿qué tienen todos estos microorganismos que es diferente entre ellos?
...
¿Alguna idea?
Quizá la imagen os de una pista... 🧬
Pensemos: ¿qué tienen todos estos microorganismos que es diferente entre ellos?
...
¿Alguna idea?
Quizá la imagen os de una pista... 🧬
June 12, 2025 at 9:59 PM
Vamos a tener que utilizar nuestras dotes detectivescas 🕵️♂️
Pensemos: ¿qué tienen todos estos microorganismos que es diferente entre ellos?
...
¿Alguna idea?
Quizá la imagen os de una pista... 🧬
Pensemos: ¿qué tienen todos estos microorganismos que es diferente entre ellos?
...
¿Alguna idea?
Quizá la imagen os de una pista... 🧬
Pero, ¿y si el hongo aún sigue libre por el campo de cultivo? 🌾
Ya hablamos de que hay muchísimos organismos en el suelo, la mayoría invisibles a simple vista 👀. Entonces, ¿cómo encontramos al hongo culpable entre tanta multitud? 🤔
Ya hablamos de que hay muchísimos organismos en el suelo, la mayoría invisibles a simple vista 👀. Entonces, ¿cómo encontramos al hongo culpable entre tanta multitud? 🤔
a large crowd of people are gathered in front of a building that says indycar on it
ALT: a large crowd of people are gathered in front of a building that says indycar on it
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June 12, 2025 at 9:59 PM
Pero, ¿y si el hongo aún sigue libre por el campo de cultivo? 🌾
Ya hablamos de que hay muchísimos organismos en el suelo, la mayoría invisibles a simple vista 👀. Entonces, ¿cómo encontramos al hongo culpable entre tanta multitud? 🤔
Ya hablamos de que hay muchísimos organismos en el suelo, la mayoría invisibles a simple vista 👀. Entonces, ¿cómo encontramos al hongo culpable entre tanta multitud? 🤔
Aquí nuestra investigación se pone seria: ¿cómo de difícil es identificar a los hongos que producen micotoxinas? 🔬
Si tienes al hongo detenido en comisaría (es decir, en una placa de Petri en el laboratorio), la cosa es más o menos sencilla. Le hacemos preguntas (pruebas) hasta que confiese 👊
Si tienes al hongo detenido en comisaría (es decir, en una placa de Petri en el laboratorio), la cosa es más o menos sencilla. Le hacemos preguntas (pruebas) hasta que confiese 👊
Eric Andre GIF
ALT: Eric Andre GIF
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June 12, 2025 at 9:59 PM
Aquí nuestra investigación se pone seria: ¿cómo de difícil es identificar a los hongos que producen micotoxinas? 🔬
Si tienes al hongo detenido en comisaría (es decir, en una placa de Petri en el laboratorio), la cosa es más o menos sencilla. Le hacemos preguntas (pruebas) hasta que confiese 👊
Si tienes al hongo detenido en comisaría (es decir, en una placa de Petri en el laboratorio), la cosa es más o menos sencilla. Le hacemos preguntas (pruebas) hasta que confiese 👊
Para evitar que las micotoxinas entren a la cadena alimentaria hay dos opciones: destruirlas o evitar que el hongo las produzca.
Prevenir es más eficaz, pero requiere saber exactamente qué hongos las producen. No podemos eliminarlos a todos: también hay hongos buenos e inocentes en el suelo 😇
Prevenir es más eficaz, pero requiere saber exactamente qué hongos las producen. No podemos eliminarlos a todos: también hay hongos buenos e inocentes en el suelo 😇
a cat with a sad look on its face
ALT: a cat with a sad look on its face
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June 12, 2025 at 9:59 PM
Para evitar que las micotoxinas entren a la cadena alimentaria hay dos opciones: destruirlas o evitar que el hongo las produzca.
Prevenir es más eficaz, pero requiere saber exactamente qué hongos las producen. No podemos eliminarlos a todos: también hay hongos buenos e inocentes en el suelo 😇
Prevenir es más eficaz, pero requiere saber exactamente qué hongos las producen. No podemos eliminarlos a todos: también hay hongos buenos e inocentes en el suelo 😇
Las micotoxinas son compuestos tóxicos que, al ingerirse de forma continuada, pueden provocar fallos hepáticos, inmunodepresión… e incluso cáncer 😨
Algunos de los hongos que más las producen pertenecen al género Fusarium. Quédate con ese nombre: uno de ellos es nuestro principal sospechoso… 🕵️
Algunos de los hongos que más las producen pertenecen al género Fusarium. Quédate con ese nombre: uno de ellos es nuestro principal sospechoso… 🕵️
June 12, 2025 at 9:59 PM
Las micotoxinas son compuestos tóxicos que, al ingerirse de forma continuada, pueden provocar fallos hepáticos, inmunodepresión… e incluso cáncer 😨
Algunos de los hongos que más las producen pertenecen al género Fusarium. Quédate con ese nombre: uno de ellos es nuestro principal sospechoso… 🕵️
Algunos de los hongos que más las producen pertenecen al género Fusarium. Quédate con ese nombre: uno de ellos es nuestro principal sospechoso… 🕵️
Empecemos por el principio. La escena del crimen: los campos de cultivo 🌾
En estos suelos hay mucha vida: lombrices, insectos, bacterias... 🐛🦠
Y entre todos ellos, encontramos a nuestros sospechosos principales: los hongos.
Pero no todos ellos: sólo los que producen #micotoxinas ☣️
En estos suelos hay mucha vida: lombrices, insectos, bacterias... 🐛🦠
Y entre todos ellos, encontramos a nuestros sospechosos principales: los hongos.
Pero no todos ellos: sólo los que producen #micotoxinas ☣️
June 12, 2025 at 9:59 PM
Empecemos por el principio. La escena del crimen: los campos de cultivo 🌾
En estos suelos hay mucha vida: lombrices, insectos, bacterias... 🐛🦠
Y entre todos ellos, encontramos a nuestros sospechosos principales: los hongos.
Pero no todos ellos: sólo los que producen #micotoxinas ☣️
En estos suelos hay mucha vida: lombrices, insectos, bacterias... 🐛🦠
Y entre todos ellos, encontramos a nuestros sospechosos principales: los hongos.
Pero no todos ellos: sólo los que producen #micotoxinas ☣️