第二次世界大戦の勃発ののち、シカゴ大学で古代人の世界観に関して講義。戦後、フランクフォートはウォーバーグ研究所の所長に任命され、一家はイギリスに移住した。1952年には夫婦は離婚、アンリ・「ハンス」・フランクフォートはエンリケタ・ハリスと再婚した。単著Arrest and Movement: An Essay on Space and Time in the Representational Art of the Ancient Near East (Chicago: Faber and Faber, 1951, Harvard: Harvard University Press, 1987)