Julien Fumey
@julienfumey.fr
Computational biologist working on ancient DNA @pasteur.fr | love cavefish | Webmaster of the French Society for Computational Biology (SFBI) @sfbi.fr | Alumni JeBiF RSG France | Views are my own
I just completed "Printing Department" - Day 4 - Advent of Code 2025 #AdventOfCode adventofcode.com/2025/day/4
Day 4 - Advent of Code 2025
adventofcode.com
December 4, 2025 at 8:02 AM
I just completed "Printing Department" - Day 4 - Advent of Code 2025 #AdventOfCode adventofcode.com/2025/day/4
I just completed "Lobby" - Day 3 - Advent of Code 2025 #AdventOfCode adventofcode.com/2025/day/3
Day 3 - Advent of Code 2025
adventofcode.com
December 3, 2025 at 6:25 PM
I just completed "Lobby" - Day 3 - Advent of Code 2025 #AdventOfCode adventofcode.com/2025/day/3
I just completed "Gift Shop" - Day 2 - Advent of Code 2025 #AdventOfCode adventofcode.com/2025/day/2
Day 2 - Advent of Code 2025
adventofcode.com
December 2, 2025 at 7:56 PM
I just completed "Gift Shop" - Day 2 - Advent of Code 2025 #AdventOfCode adventofcode.com/2025/day/2
I just completed "Secret Entrance" - Day 1 - Advent of Code 2025 #AdventOfCode adventofcode.com/2025/day/1
Day 1 - Advent of Code 2025
adventofcode.com
December 2, 2025 at 6:46 PM
I just completed "Secret Entrance" - Day 1 - Advent of Code 2025 #AdventOfCode adventofcode.com/2025/day/1
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Still looking for our perfect doctoral candidate as part of @evomg-dn.bsky.social - come and join us to work on the evolutionary pressures that shape gene expression and disease in the uterus!
Please RT (or is it RB? not sure how our lingo has changed!)
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🚨 15 days left to apply!
Be part of EvoMG-DN and advance your PhD career in evolutionary genomics.
👉 www.evomg-dn.eu
#PhD #DoctoralTraining #ResearchCareers #LifeSciences #BiomedicalResearch #Genomics #EvolutionaryBiology #MSCA #HorizonEurope #EUResearch #ResearchOpportunities #PhDPositions
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November 14, 2025 at 10:22 AM
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137 years ago today 🎂 Institut Pasteur opened in Paris (Nov 14, 1888 🏛️)
Funded by 100K+ donors after the rabies vaccine success, it launched a scientific legacy:
🔬 10 Nobel Prizes
🌍 32 Pasteur Network Institutes
💉 Countless lives saved
From rabies to COVID-19, the mission continues.
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🔬 10 Nobel Prizes
🌍 32 Pasteur Network Institutes
💉 Countless lives saved
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November 14, 2025 at 8:23 AM
137 years ago today 🎂 Institut Pasteur opened in Paris (Nov 14, 1888 🏛️)
Funded by 100K+ donors after the rabies vaccine success, it launched a scientific legacy:
🔬 10 Nobel Prizes
🌍 32 Pasteur Network Institutes
💉 Countless lives saved
From rabies to COVID-19, the mission continues.
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🔬 10 Nobel Prizes
🌍 32 Pasteur Network Institutes
💉 Countless lives saved
From rabies to COVID-19, the mission continues.
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"...researchers who invest time in their students tend to lead more-productive, more-collaborative groups and attract stronger future students than those who do not." "Time spent with the next generation of scientists is an investment."
www.nature.com/articles/d41...
www.nature.com/articles/d41...
What makes PhD students happy? Good supervision
Supervisors who invest in positive mentoring relationships with their PhD candidates also reap the benefits for their own research.
www.nature.com
October 24, 2025 at 10:46 PM
"...researchers who invest time in their students tend to lead more-productive, more-collaborative groups and attract stronger future students than those who do not." "Time spent with the next generation of scientists is an investment."
www.nature.com/articles/d41...
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Comment Napoléon a été vaincu en Russie par une armée de bactéries : ce que l’ADN révèle de la débâcle de la Bérézina
www.nouvelobs.com/sciences/202...
www.nouvelobs.com/sciences/202...
Comment Napoléon a été vaincu en Russie par une armée de bactéries : ce que l’ADN révèle de la débâcle de la Bérézina
Des analyses menées sur des restes de soldats révèlent deux nouvelles maladies inattendues qui ont conduit à la débâcle de l’armée napoléonienne en Russie en 1812.
www.nouvelobs.com
October 24, 2025 at 3:25 PM
Comment Napoléon a été vaincu en Russie par une armée de bactéries : ce que l’ADN révèle de la débâcle de la Bérézina
www.nouvelobs.com/sciences/202...
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John Lodge, chanteur et bassiste des Moody Blues, est mort à 82 ans
John Lodge, chanteur et bassiste des Moody Blues, est mort à 82 ans
Le groupe, dont tous les membres fondateurs sont décédés, a vendu plus de 70 millions d’albums dans le monde.
www.lemonde.fr
October 10, 2025 at 3:55 PM
John Lodge, chanteur et bassiste des Moody Blues, est mort à 82 ans
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Fait étonnant : le direct de Libération sur la démission de Lecornu aura duré plus longtemps que le gouvernement Lecornu.
À suivre ici : www.liberation.fr/politique/en...
À suivre ici : www.liberation.fr/politique/en...
October 6, 2025 at 7:30 PM
Fait étonnant : le direct de Libération sur la démission de Lecornu aura duré plus longtemps que le gouvernement Lecornu.
À suivre ici : www.liberation.fr/politique/en...
À suivre ici : www.liberation.fr/politique/en...
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Dr. Jane Goodall, who will be remembered as an advocate for animals and a renowned chimpanzee researcher, died due to natural causes, the Jane Goodall Institute announced.
nbcnews.to/48bAFgj
nbcnews.to/48bAFgj
October 1, 2025 at 6:15 PM
Dr. Jane Goodall, who will be remembered as an advocate for animals and a renowned chimpanzee researcher, died due to natural causes, the Jane Goodall Institute announced.
nbcnews.to/48bAFgj
nbcnews.to/48bAFgj
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At least 300,000 men died during Napoleon’s retreat from Russia - now the latest genetic techniques have identified two pathogens that may have contributed to some of the deaths
DNA analysis reveals what really killed Napoleon's army in 1812
At least 300,000 men died during Napoleon’s retreat from Russia - now the latest genetic techniques have identified two pathogens that may have contributed to some of the deaths
www.newscientist.com
August 9, 2025 at 6:24 PM
At least 300,000 men died during Napoleon’s retreat from Russia - now the latest genetic techniques have identified two pathogens that may have contributed to some of the deaths
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I am starting a computational lab at LIOS, Riga, Latvia, and going to recruit a few people. Please DM if you are interested in a postdoc or PhD position in my Metabolic Research Group within the TARGETWISE project. I can highly recommend Riga, it is a beautiful city with very good living conditions.
July 18, 2025 at 9:03 AM
I am starting a computational lab at LIOS, Riga, Latvia, and going to recruit a few people. Please DM if you are interested in a postdoc or PhD position in my Metabolic Research Group within the TARGETWISE project. I can highly recommend Riga, it is a beautiful city with very good living conditions.
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Calling all meeting organizers… @biologists.bsky.social now have a calculator to estimate your event’s carbon footprint and to test various reduction scenarios.
thenode.biologists.com/event-carbon...
thenode.biologists.com/event-carbon...
Event carbon calculator - the Node
I am excited to announce the release of our event carbon calculator, our latest resource to support the creation of sustainable events. Estimate your
thenode.biologists.com
July 1, 2025 at 10:01 AM
Calling all meeting organizers… @biologists.bsky.social now have a calculator to estimate your event’s carbon footprint and to test various reduction scenarios.
thenode.biologists.com/event-carbon...
thenode.biologists.com/event-carbon...
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‼️ Le 42ème numéro des #bioinformations est désormais en ligne ‼️
Retrouvez, entre autres articles :
🍻 @jebif.bsky.social en live sur Twitch et dans les pubs
💼 nouvelle illustration métier
📚 auto #formation à R
💬 groupes de travail du GDR-BIMMM et MERIT
🤓 Bonne lecture sur bioinformations.fr
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🤓 Bonne lecture sur bioinformations.fr
‼️ 42ème numéro des #bioinformations en ligne ‼️
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➕ et bien plus encore ...
📰 Bonne lecture sur bioinformations.fr 🤓
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June 18, 2025 at 6:42 AM
‼️ Le 42ème numéro des #bioinformations est désormais en ligne ‼️
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SAUVONS LE PALAIS DE LA DÉCOUVERTE
www.change.org/p/sauvons-le...
(Avis personnel : des musées comme le Grand Palais, il y en a plein à Paris. Il n'y a qu'un Palais de la Découverte.)
www.change.org/p/sauvons-le...
(Avis personnel : des musées comme le Grand Palais, il y en a plein à Paris. Il n'y a qu'un Palais de la Découverte.)
Signez la pétition
Sauvons le Palais de la découverte
www.change.org
June 14, 2025 at 5:57 AM
SAUVONS LE PALAIS DE LA DÉCOUVERTE
www.change.org/p/sauvons-le...
(Avis personnel : des musées comme le Grand Palais, il y en a plein à Paris. Il n'y a qu'un Palais de la Découverte.)
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Une nouvelle étude révèle que la bipédie occasionnelle des babouins présente des ressemblances avec la nôtre. Avec de légères modifications du bassin, leur locomotion pourrait être aussi "efficace" que celle des humains. Un résultat qui éclaire l'origine de la bipédie humaine
Avec François Druelle 🚶
Avec François Druelle 🚶
L'origine de la bipédie humaine à travers la démarche des babouins
Une nouvelle étude révèle que la bipédie occasionnelle des babouins présente des ressemblances avec la nôtre. Avec de légères modifications du bassin, leur locomotion pourrait être aussi énergétiqueme...
www.radiofrance.fr
June 12, 2025 at 5:41 AM
Une nouvelle étude révèle que la bipédie occasionnelle des babouins présente des ressemblances avec la nôtre. Avec de légères modifications du bassin, leur locomotion pourrait être aussi "efficace" que celle des humains. Un résultat qui éclaire l'origine de la bipédie humaine
Avec François Druelle 🚶
Avec François Druelle 🚶
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A new Science study shows that the mycobacterium M. lepromatosis infected humans in the Americas before European contact.
The findings reshape current views of leprosy in the Americas and provide insights into the long-term interactions between humans and infectious diseases. scim.ag/3HuEjGB
The findings reshape current views of leprosy in the Americas and provide insights into the long-term interactions between humans and infectious diseases. scim.ag/3HuEjGB
May 29, 2025 at 7:33 PM
A new Science study shows that the mycobacterium M. lepromatosis infected humans in the Americas before European contact.
The findings reshape current views of leprosy in the Americas and provide insights into the long-term interactions between humans and infectious diseases. scim.ag/3HuEjGB
The findings reshape current views of leprosy in the Americas and provide insights into the long-term interactions between humans and infectious diseases. scim.ag/3HuEjGB
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La culture scientifique, c'est aussi de la culture.
On vous voit, @grandpalaisrmn.bsky.social qui essaie de grignoter les espaces et le #ministèredelaCulture qui laisse faire. 😠
@universcience.bsky.social, nous attendons beaucoup de vous pour défendre ce patrimoine de la médiation scientifique.
On vous voit, @grandpalaisrmn.bsky.social qui essaie de grignoter les espaces et le #ministèredelaCulture qui laisse faire. 😠
@universcience.bsky.social, nous attendons beaucoup de vous pour défendre ce patrimoine de la médiation scientifique.
La réouverture temporaire du Palais de la découverte, le 11 juin, a été annulée dans la confusion.
Salariés du musée et scientifiques s'inquiètent pour l'avenir d'une institution affaiblie et attaquée depuis des années.
Lire l'article ➡️ https://l.reporterre.net/2cY
Salariés du musée et scientifiques s'inquiètent pour l'avenir d'une institution affaiblie et attaquée depuis des années.
Lire l'article ➡️ https://l.reporterre.net/2cY
May 28, 2025 at 3:12 PM
La culture scientifique, c'est aussi de la culture.
On vous voit, @grandpalaisrmn.bsky.social qui essaie de grignoter les espaces et le #ministèredelaCulture qui laisse faire. 😠
@universcience.bsky.social, nous attendons beaucoup de vous pour défendre ce patrimoine de la médiation scientifique.
On vous voit, @grandpalaisrmn.bsky.social qui essaie de grignoter les espaces et le #ministèredelaCulture qui laisse faire. 😠
@universcience.bsky.social, nous attendons beaucoup de vous pour défendre ce patrimoine de la médiation scientifique.
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MALDIBANK EU Project is about to kick-off !
During these 2 days, we will discuss the project action plan on how to conceptualise an open databank comprising microbial categorisation as a way of easing studies ranging from ecosystem dynamics, environmental issues and health matters.
During these 2 days, we will discuss the project action plan on how to conceptualise an open databank comprising microbial categorisation as a way of easing studies ranging from ecosystem dynamics, environmental issues and health matters.
May 13, 2025 at 7:06 AM
MALDIBANK EU Project is about to kick-off !
During these 2 days, we will discuss the project action plan on how to conceptualise an open databank comprising microbial categorisation as a way of easing studies ranging from ecosystem dynamics, environmental issues and health matters.
During these 2 days, we will discuss the project action plan on how to conceptualise an open databank comprising microbial categorisation as a way of easing studies ranging from ecosystem dynamics, environmental issues and health matters.
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conferencia virtual “The Ghostly Presence of Race Science in
Indigenous Genomics - El fantasma de la ciencia racial en la genómica” donde Emma Kowal hablará de la genomica indígena en el siglo XXI en el contexto Australiano.
Indigenous Genomics - El fantasma de la ciencia racial en la genómica” donde Emma Kowal hablará de la genomica indígena en el siglo XXI en el contexto Australiano.
May 13, 2025 at 12:48 AM
conferencia virtual “The Ghostly Presence of Race Science in
Indigenous Genomics - El fantasma de la ciencia racial en la genómica” donde Emma Kowal hablará de la genomica indígena en el siglo XXI en el contexto Australiano.
Indigenous Genomics - El fantasma de la ciencia racial en la genómica” donde Emma Kowal hablará de la genomica indígena en el siglo XXI en el contexto Australiano.
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Pour plus d’infos, une revue en français que nous avons écrite il y a 10 ans avec Didier Casane et @julienfumey.fr
www.medecinesciences.org/fr/articles/...
www.medecinesciences.org/fr/articles/...
April 22, 2025 at 8:52 PM
Pour plus d’infos, une revue en français que nous avons écrite il y a 10 ans avec Didier Casane et @julienfumey.fr
www.medecinesciences.org/fr/articles/...
www.medecinesciences.org/fr/articles/...
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Sketch, capture and layout phylogenies www.biorxiv.org/content/10.1... 🧬🖥️🧪 github.com/husonlab/phy...
April 3, 2025 at 3:54 PM
Sketch, capture and layout phylogenies www.biorxiv.org/content/10.1... 🧬🖥️🧪 github.com/husonlab/phy...
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CompactTree: a lightweight header-only C++ library and Python wrapper for ultra-large phylogenetics https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40110034/
March 21, 2025 at 2:26 AM
CompactTree: a lightweight header-only C++ library and Python wrapper for ultra-large phylogenetics https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40110034/