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Institut Français de Bioinformatique et noeud français d'ELIXIR Europe
The Institut Français de Bioinformatique is the national #bioinformatics infrastructure for #lifesciences communities and the French node of #ELIXIREurope
📢🚀💻Le nouveau site internet de l’IFB/ELIXIR-FR est en ligne !!!
Lancé début 2025, le projet de refonte/création du nouveau site internet de l’IFB/ELIXIR-FR atteint aujourd’hui l’une de ses étapes cruciales : sa publication ! www.ifb-elixir.fr
November 28, 2025 at 1:01 PM
📢🗓️👩‍💻 Vous êtes intéressés par la formation "Bioinformatique intégrative : principes et mise en œuvre sur un jeu de données multi-omiques " qui se déroulera à Fréjus du 29 mars au 3 avril 2026 ? Vous ne vous êtes pas encore pré-inscrits ? N'attendez plus, il est encore temps jusqu'au 17 décembre !
📢👩‍💻✍️ Inscription - Ecole thématique en bioinformatique intégrative (ETBII) du 29/03 au 3/04/2026, organisée par l’IFB !
🎯 Au programme : Combiner et analyser des données biologiques multi-omiques issues de différentes sources afin d’obtenir une compréhension globale des systèmes biologiques
November 26, 2025 at 10:27 AM
👏 Fin de la formation EB3I 2025 !
Merci aux participants et aux experts pour cette semaine enrichissante à Roscoff. Près de 82,1% des participants avaient un besoin important ou indispensable des apprentissages dispensés et 89,7% sont satisfaits de l’équilibre entre théorie et pratique.
November 24, 2025 at 12:47 PM
📣 🚀 L’équipe dev de Cloud4SAMS s’est réunie les 19 et 20 novembre dans les locaux de l’IFB-core sur le campus CNRS de Villejuif pour un hackathon dédié à l’innovation et à l’évolution du projet. 2 jours de travail intense pour proposer encore plus de fonctionnalités à notre infrastructure numérique.
November 24, 2025 at 10:02 AM
🧬 🔎 Ce 17 novembre a eu lieu la journée du consortium ABRomics à l’Institut Pasteur. L’occasion de présenter aux différents représentants de nos parties prenantes l’avancement du projet et les développements en cours !
November 20, 2025 at 1:44 PM
🚀🧬Début de la formation EB3I 2025 à Roscoff !
Au programme de cette semaine, le traitement de données de variants, ChIP-Seq, Bulk RNA-Seq, et Single-Cell RNA-Seq !
moodle.france-bioinformatique.fr/course/view....
#Bioinformatique #NGS #Formation
November 17, 2025 at 3:29 PM
🚀👩‍💻🧑‍💻 End of this week of #BioHackEU25, organised by @elixir-europe.org , to advance all projects in synergy! Thank you to the IFB/ELIXIR-FR team (on-site and remotely), and to our colleagues at @genouest.bsky.social 👏
November 7, 2025 at 12:29 PM
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Attending #BioHackathonEurope2025 organized by @elixir-europe.org in Berlin with many colleagues from @ifb-elixir-fr.bsky.social ! 🚀
5 days of collaborating work and active coding to advance on projects. 👩‍💻🧑‍💻🧬💥
November 6, 2025 at 4:17 PM
📢🚨Recrutement d’un·e ngénieur-e d'études en conception et diffusion de ressources pédagogiques pour la gestion et l'analyse des données de microbiomes et de santé !
📍 Jouy-en-Josas (78) / 💼 CDD de 20mois
🔎 emploi.cnrs.fr/Offres/CDD/U...
#Recrutement #Ingénieur #FAIR #Bioinformatique #Data
November 6, 2025 at 10:01 AM
Reposted by IFB/ELIXIR-Fr
So happy to be a part of this event this year again! 😃

Working on "Improving package annotation in metabolomics and proteomics via robust, ontology-driven LLM integration" 👩🏻‍💻👾

github.com/elixir-europ...

@bioconductor.bsky.social @ifb-elixir-fr.bsky.social
November 4, 2025 at 10:40 AM
📢👩‍💻✍️ Inscription - Ecole thématique en bioinformatique intégrative (ETBII) du 29/03 au 3/04/2026, organisée par l’IFB !
🎯 Au programme : Combiner et analyser des données biologiques multi-omiques issues de différentes sources afin d’obtenir une compréhension globale des systèmes biologiques
November 4, 2025 at 8:43 AM
🚀 IFB is attending the #BioHackathonEurope 2025 organised by @elixir-europe.org from 3 to 7 November in Berlin !
For more information => www.linkedin.com/feed/update/...
November 3, 2025 at 4:36 PM
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👏 Highlights from the ATLASea 2025 General Assembly!
October 16–17, the ATLASea GA took place at the Auditorium of the Grande Galerie de l’Évolution, @mnhn.fr
Two intense days of presentations and discussions on the program’s progress 🌊
✨ Thank you to speakers and participants for their engagement!
October 20, 2025 at 11:03 AM
Reposted by IFB/ELIXIR-Fr
🎬 Advance screening of the documentary “ATLASea: In Pursuit of Marine Genomes” at Le Grand Action cinema!
On Oct 16, during the ATLASea General Assembly, members attended the advance screening of this inspiring film 🌊🔬
📺 Diffused on Ushuaïa TV, Sat Oct 18 at 8:30 p.m.: ushuaiatv.fr/programmes/a...
October 20, 2025 at 11:07 AM
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On October 15-16, the second edition of the BYTE-Sea Hackathon took place at the @mnhn.fr .

The program included data frame harmonisation, comparative genomics and functional annotation.

#hackathon #bioinformatics #ATLASea
October 20, 2025 at 11:11 AM
🚀💻The GALAXY France team was present at the European @galaxyproject.bsky.social Days 2025. Thank you for three intense days!
@elixir-europe.org
1–3 Oct 2025, Freiburg: European Galaxy Days, ELIXIR Galaxy, and EuroScienceGateway members convened to align roadmaps and turn plans into solutions, tools, and workflows through talks, demos, and a CoFest.
https://galaxyproject.org/news/2025-10-15-egd2025/

##UseGalaxy ##GalaxyProject ##EOSC (1/2)
October 20, 2025 at 11:51 AM
🚨🚧🖥 As a reminder, the servers will be shut down today at 14h.🚨🚧🖥
Service is expected to resume :
October 6, 2025 at 7:23 AM
📣🚀💻 #Hackathon de l’équipe de dev d’ #ABRomics à Clermont-Ferrand ! Quelques jours intenses pour proposer encore plus de fonctionnalités sur la plateforme numérique dédiée à la surveillance génomique et la recherche sur l’antibiorésistance.
October 2, 2025 at 8:11 AM
Reposted by IFB/ELIXIR-Fr
🚨🚧UPDATE 📢 Wednesday, October 8 at 12h : Resumption of all IFB services (website, Atlasea portal, ABRromics portal, Moodle training, Fair Checker, DSW, sandbox)

Friday, October 10 at 18h : Resumption of Cluster services (OnDemand, Usegalaxy, Community, My, ABRomics platform)
September 22, 2025 at 7:31 AM
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🚨📢🖥 Server maintenance 🖥📢🚨
🗓️ From 6 to 8 October 2025, the IFB's tools and websites (IFB, #ABRomics, DSW, Fair-checker, OnDemand, ...) will be unavailable due to the IDRIS #servers being shut down for #maintenance.
Thank you for your understanding !
#data #bioinformatique #cluster #cloud
September 18, 2025 at 1:45 PM
📢 L’IFB & iPOP-UP (EDC) organisent 3 jours de formation du 29/09 au 1/10 pour maîtriser les langages de #workflows #Snakemake & #Nextflow 🧬💻. Optimisez vos analyses bioinformatiques et assurez leur reproductibilité !
🔎https://urlr.me/597tKC

#Bioinfo #Formation #Cloud #Cluster
September 30, 2025 at 9:27 AM
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✨ This Wednesday, ELIXIR is holding a webinar to explore the journey of #ELIXIR_Germany (denbi.bsky.social) – from its early beginnings to its current role as a key part of the European ELIXIR network.
📆 24 September 2025 🕒 15:00-16:00 CEST
Register now 👉 https://loom.ly/erUveaI
September 22, 2025 at 12:15 PM
🚨📢🖥 Server maintenance 🖥📢🚨
🗓️ From 6 to 8 October 2025, the IFB's tools and websites (IFB, #ABRomics, DSW, Fair-checker, OnDemand, ...) will be unavailable due to the IDRIS #servers being shut down for #maintenance.
Thank you for your understanding !
#data #bioinformatique #cluster #cloud
September 18, 2025 at 1:45 PM
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EuroBioC2025 is in full swing here in Barcelona!

Day 1 was full of great talks, conversations, and that amazing Bioconductor community energy. Excited for what’s ahead today and tomorrow!

#EuroBioC2025 #Bioconductor #OpenScience #Community
September 18, 2025 at 12:10 PM
Reposted by IFB/ELIXIR-Fr
First day of the 2025 European Bioconductor conference! 🙌🏻🇪🇸

📍PRBB, Barcelona, Spain
@bioconductor.bsky.social @ifb-elixir-fr.bsky.social
September 17, 2025 at 9:08 AM