Hadrien Gourlé
@hadrieng.bsky.social
I tell computers to analyse bacteria and viruses. Most often they refuse.
Doing research and politics for a better, kinder world.
Postdoc @ Umeå University
Utredare @ Folkhälsomyndigheten
Ledamot (Vänsterpartiet) @ samhällsbyggnadsnämnden Örnsköldsvik
Doing research and politics for a better, kinder world.
Postdoc @ Umeå University
Utredare @ Folkhälsomyndigheten
Ledamot (Vänsterpartiet) @ samhällsbyggnadsnämnden Örnsköldsvik
Pinned
Hadrien Gourlé
@hadrieng.bsky.social
· Nov 19
Hi there! My name is Hadrien, I'm a researcher who's developing computational methods to further our understanding of microbes 🦠💻
You can expect posts in English about science, in Swedish about politics, and occasionally (very often) posts about my code not working
You can expect posts in English about science, in Swedish about politics, and occasionally (very often) posts about my code not working
Reposted by Hadrien Gourlé
När högerns sociala arrogans och SDs rasism förenas i socialpolitiken är risken stor att fler unga pressas till kriminalitet. Erfarenheter från andra länder och rationella argument biter inte på ideologiska dogmatiker. Bra av @martinnordin.bsky.social här!👇🏼
www.sverigesradio.se/artikel/ekon...
www.sverigesradio.se/artikel/ekon...
September 19, 2025 at 6:20 AM
När högerns sociala arrogans och SDs rasism förenas i socialpolitiken är risken stor att fler unga pressas till kriminalitet. Erfarenheter från andra länder och rationella argument biter inte på ideologiska dogmatiker. Bra av @martinnordin.bsky.social här!👇🏼
www.sverigesradio.se/artikel/ekon...
www.sverigesradio.se/artikel/ekon...
Många ord för att säga att man vill inte lägga pengar på kollektivtrafik
www.allehanda.se/2025-06-05/s...
www.allehanda.se/2025-06-05/s...
Svårlösta frågan
”Väldigt dyrt att driva.”
www.allehanda.se
June 5, 2025 at 10:24 AM
Många ord för att säga att man vill inte lägga pengar på kollektivtrafik
www.allehanda.se/2025-06-05/s...
www.allehanda.se/2025-06-05/s...
Reposted by Hadrien Gourlé
A long thread about mpox and the context specific nature of outbreaks prompted by the large outbreak of MPXV Clade IIb happening at the moment in Sierra Leone:
May 25, 2025 at 11:29 AM
A long thread about mpox and the context specific nature of outbreaks prompted by the large outbreak of MPXV Clade IIb happening at the moment in Sierra Leone:
Very nice work by Martin Larralde and Josefin Blom! IGUA clusters multi-gene clusters more than 10x the state-of-the-art method, and can scale to millions of multi-gene clusters. Awesome work to get this preprint out folks 🎉
www.biorxiv.org/content/10.1...
www.biorxiv.org/content/10.1...
Fast, flexible gene cluster family delineation with IGUA
Prokaryotic genomes harbor a variety of functional elements encoded as contiguous multi-gene clusters, with biosynthetic gene clusters (BGCs, genetic determinants of secondary metabolite biosynthesis)...
www.biorxiv.org
May 27, 2025 at 9:20 AM
Very nice work by Martin Larralde and Josefin Blom! IGUA clusters multi-gene clusters more than 10x the state-of-the-art method, and can scale to millions of multi-gene clusters. Awesome work to get this preprint out folks 🎉
www.biorxiv.org/content/10.1...
www.biorxiv.org/content/10.1...
Bra och rolig text!
May 27, 2025 at 5:49 AM
Bra och rolig text!
Regeringen, 2 dagar sen: "Israels agerande är oacceptabelt".
Idag, Sverige är det ända landet i EU som blockerar nödhjälp. Regeringens fördömande är ett spel för galleriet, Sveriges rasistiska regeringen stödjer Israels folkmord
www.dn.se/sverige/sida...
Idag, Sverige är det ända landet i EU som blockerar nödhjälp. Regeringens fördömande är ett spel för galleriet, Sveriges rasistiska regeringen stödjer Israels folkmord
www.dn.se/sverige/sida...
Sida vill ge nödhjälp till Unrwa – bakbinds av regeringen
Mitt under kriget mellan Israel och Hamas stoppade regeringen biståndet till Unrwa, FN:s hjälporganisation för palestinska flyktingar.
www.dn.se
May 21, 2025 at 4:51 AM
Regeringen, 2 dagar sen: "Israels agerande är oacceptabelt".
Idag, Sverige är det ända landet i EU som blockerar nödhjälp. Regeringens fördömande är ett spel för galleriet, Sveriges rasistiska regeringen stödjer Israels folkmord
www.dn.se/sverige/sida...
Idag, Sverige är det ända landet i EU som blockerar nödhjälp. Regeringens fördömande är ett spel för galleriet, Sveriges rasistiska regeringen stödjer Israels folkmord
www.dn.se/sverige/sida...
Reposted by Hadrien Gourlé
TITTA INTE BORT. www.aftonbladet.se/nyheter/a/Oo...
May 21, 2025 at 4:19 AM
TITTA INTE BORT. www.aftonbladet.se/nyheter/a/Oo...
14 000 bebisar riskerar att dö inom 48 timmar. Så ser Israels krigsföring ut
omni.se/fn-larmar-14...
omni.se/fn-larmar-14...
FN: 14 000 bebisar riskerar att dö inom 48 timmar
Tusentals spädbarn riskerar att dö i Gaza om inte hjälpsändningarna når dem inom kort. Det säger FN:s nödhjälpschef Tom Fletcher till BBC.
omni.se
May 20, 2025 at 9:22 AM
14 000 bebisar riskerar att dö inom 48 timmar. Så ser Israels krigsföring ut
omni.se/fn-larmar-14...
omni.se/fn-larmar-14...
Great explanatory thread and interesting tool 👀
Delighted to see this paper from danderson123.bsky.social 's PhD out. We have been building tools for AMR gene detection for over a decade now, but multicopy genes remain challenging. Dan shows that with a gene-space de Bruijn graph and long reads, you can do well
www.biorxiv.org/content/10.1...
www.biorxiv.org/content/10.1...
May 19, 2025 at 9:51 AM
Great explanatory thread and interesting tool 👀
Reposted by Hadrien Gourlé
JOAKIM MEDIN ÄR PÅ VÄG HEM ❤️❤️❤️
May 16, 2025 at 4:33 PM
JOAKIM MEDIN ÄR PÅ VÄG HEM ❤️❤️❤️
Bevara Sollefteå sjukhus!
Efter åtta konfliktfyllda år står det klart – enorma nedskärningar kommer att genomföras på Sollefteå sjukhus.
– Snarare kommer det att bli dyrare vård och med stora risker för sänkt patientsäkerhet, säger Lars Rocksén, vice ordförande för Sveriges läkarförbund.
– Snarare kommer det att bli dyrare vård och med stora risker för sänkt patientsäkerhet, säger Lars Rocksén, vice ordförande för Sveriges läkarförbund.
Klart: Stora delar av Sollefteå sjukhus lägger ner
Aktivisten: ”Vi tänker inte ge upp”
www.etc.se
May 6, 2025 at 5:12 AM
Bevara Sollefteå sjukhus!
Reposted by Hadrien Gourlé
-Centerpartiets partiledare har varit VD för skolkoncern.
-Skolministern har suttit i skolkoncerns styrelse.
-Statsministerns fru sitter i skolkoncerns styrelse.
-Statsministerns bästa vän har suttit i skolkoncerns styrelse.
-Friskolereformsarkitekterna äger varsin skolkoncern.
-Skolministern har suttit i skolkoncerns styrelse.
-Statsministerns fru sitter i skolkoncerns styrelse.
-Statsministerns bästa vän har suttit i skolkoncerns styrelse.
-Friskolereformsarkitekterna äger varsin skolkoncern.
May 5, 2025 at 5:06 AM
-Centerpartiets partiledare har varit VD för skolkoncern.
-Skolministern har suttit i skolkoncerns styrelse.
-Statsministerns fru sitter i skolkoncerns styrelse.
-Statsministerns bästa vän har suttit i skolkoncerns styrelse.
-Friskolereformsarkitekterna äger varsin skolkoncern.
-Skolministern har suttit i skolkoncerns styrelse.
-Statsministerns fru sitter i skolkoncerns styrelse.
-Statsministerns bästa vän har suttit i skolkoncerns styrelse.
-Friskolereformsarkitekterna äger varsin skolkoncern.
Reposted by Hadrien Gourlé
EU citizen initiative to ban conversion therapy to LGTBQ persons.
The tweet below is in Swedish but the link detects your language of choice - mine even opened in Portuguese, and just switched to Swedish once I identified with my electronic ID
The tweet below is in Swedish but the link detects your language of choice - mine even opened in Portuguese, and just switched to Swedish once I identified with my electronic ID
Dagens enkla:
Skriv under medborgarinitiativet att förbjuda "omvändelseterapi" för att "bota" hbtq-personer.
Bara Frankrike och Finland har hittills nått tröskeln för antal underskrifter.
Sverige har drygt 3000 underskrifter, och behöver nå nästan 15000 innan maj.
eci.ec.europa.eu/043/public/#...
Skriv under medborgarinitiativet att förbjuda "omvändelseterapi" för att "bota" hbtq-personer.
Bara Frankrike och Finland har hittills nått tröskeln för antal underskrifter.
Sverige har drygt 3000 underskrifter, och behöver nå nästan 15000 innan maj.
eci.ec.europa.eu/043/public/#...
European Citizens' Initiative
Give your support !
eci.ec.europa.eu
January 29, 2025 at 5:38 PM
EU citizen initiative to ban conversion therapy to LGTBQ persons.
The tweet below is in Swedish but the link detects your language of choice - mine even opened in Portuguese, and just switched to Swedish once I identified with my electronic ID
The tweet below is in Swedish but the link detects your language of choice - mine even opened in Portuguese, and just switched to Swedish once I identified with my electronic ID
Reposted by Hadrien Gourlé
If an #H5N1 pandemic starts tomorrow or in three months, there will be little mystery as to how it happened. The conditions are all there. They have been for a while.
So in some ways the more interesting question to me at the moment is: Why aren’t we in a pandemic yet?
Story here, 🧵 to come:
🧪#IDSky
So in some ways the more interesting question to me at the moment is: Why aren’t we in a pandemic yet?
Story here, 🧵 to come:
🧪#IDSky
Why hasn’t the bird flu pandemic started?
Some scientists examining mutations found in H5N1 viruses fear major outbreak is imminent but others says pathogen remains unpredictable
www.science.org
December 6, 2024 at 12:54 PM
If an #H5N1 pandemic starts tomorrow or in three months, there will be little mystery as to how it happened. The conditions are all there. They have been for a while.
So in some ways the more interesting question to me at the moment is: Why aren’t we in a pandemic yet?
Story here, 🧵 to come:
🧪#IDSky
So in some ways the more interesting question to me at the moment is: Why aren’t we in a pandemic yet?
Story here, 🧵 to come:
🧪#IDSky
Försäkringskassans modell alltså pekar ut dubbelt så många kvinnor som potentiella fuskare när vi vet att kvinnor och män gör fel i samma utsträckning? På vilka data har de tränat modellen? Vilka modeller använder de? De måste redovisa deras metoder omedelbart
www.svd.se/a/Rzmg9x/for...
www.svd.se/a/Rzmg9x/for...
www.svd.se
November 30, 2024 at 4:46 AM
Försäkringskassans modell alltså pekar ut dubbelt så många kvinnor som potentiella fuskare när vi vet att kvinnor och män gör fel i samma utsträckning? På vilka data har de tränat modellen? Vilka modeller använder de? De måste redovisa deras metoder omedelbart
www.svd.se/a/Rzmg9x/for...
www.svd.se/a/Rzmg9x/for...
Reposted by Hadrien Gourlé
Our Big Fantastic Virus Database (BFVD) is now published NAR! It contains protein structure predictions of major viral clades, enhanced by petabase-scale homology search and it's explorable on the web.
🌐 bfvd.foldseek.com
💾 bfvd.steineggerlab.workers.dev
📄 academic.oup.com/nar/advance-...
🌐 bfvd.foldseek.com
💾 bfvd.steineggerlab.workers.dev
📄 academic.oup.com/nar/advance-...
November 23, 2024 at 9:12 PM
Our Big Fantastic Virus Database (BFVD) is now published NAR! It contains protein structure predictions of major viral clades, enhanced by petabase-scale homology search and it's explorable on the web.
🌐 bfvd.foldseek.com
💾 bfvd.steineggerlab.workers.dev
📄 academic.oup.com/nar/advance-...
🌐 bfvd.foldseek.com
💾 bfvd.steineggerlab.workers.dev
📄 academic.oup.com/nar/advance-...
Reposted by Hadrien Gourlé
👀 Working on a #StarterPack for early career researchers (PhD students & Postdocs) in #genomics & #bioinformatics 🧬🖥️ Please share! Happy to add those working in this area so please suggest. Seeing a lot of PIs on here but would love to see more students 🎓🚀
November 20, 2024 at 3:38 PM
👀 Working on a #StarterPack for early career researchers (PhD students & Postdocs) in #genomics & #bioinformatics 🧬🖥️ Please share! Happy to add those working in this area so please suggest. Seeing a lot of PIs on here but would love to see more students 🎓🚀
Reposted by Hadrien Gourlé
Det här tänker jag ofta på. Det osynliga slöseriet i den privata sektorn, som aldrig diskuteras förutom när det gäller någon bransch högern hatar (typ vindkraft och grön industri).
Plus att privata sektorn inte måste berätta om sina misslyckade projekt som den offentliga måste tack vare vår offentlighetslagstiftning. Det ger en bias mot att det mest är offentliga projekt som misslyckas.
November 21, 2024 at 8:33 AM
Det här tänker jag ofta på. Det osynliga slöseriet i den privata sektorn, som aldrig diskuteras förutom när det gäller någon bransch högern hatar (typ vindkraft och grön industri).
My experience with a newborn so far: a breakdown of my day
10 - 14: 😍
14 - 18: 😍
18 - 22: 😍
22 - 02: WAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAH
02 - 06: googling "when do newborns develop a circadian rhythm" for the nth time
06 - 10: 😍
10 - 14: 😍
14 - 18: 😍
18 - 22: 😍
22 - 02: WAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAH
02 - 06: googling "when do newborns develop a circadian rhythm" for the nth time
06 - 10: 😍
November 20, 2024 at 11:12 PM
My experience with a newborn so far: a breakdown of my day
10 - 14: 😍
14 - 18: 😍
18 - 22: 😍
22 - 02: WAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAH
02 - 06: googling "when do newborns develop a circadian rhythm" for the nth time
06 - 10: 😍
10 - 14: 😍
14 - 18: 😍
18 - 22: 😍
22 - 02: WAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAH
02 - 06: googling "when do newborns develop a circadian rhythm" for the nth time
06 - 10: 😍
Hi there! My name is Hadrien, I'm a researcher who's developing computational methods to further our understanding of microbes 🦠💻
You can expect posts in English about science, in Swedish about politics, and occasionally (very often) posts about my code not working
You can expect posts in English about science, in Swedish about politics, and occasionally (very often) posts about my code not working
November 19, 2024 at 10:05 PM
Hi there! My name is Hadrien, I'm a researcher who's developing computational methods to further our understanding of microbes 🦠💻
You can expect posts in English about science, in Swedish about politics, and occasionally (very often) posts about my code not working
You can expect posts in English about science, in Swedish about politics, and occasionally (very often) posts about my code not working